Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
PECRQ9BY49 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms