Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY07

SLC4A5, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A5Q9BY07 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SLC4A5Q9BY07 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SLC4A5Q9BY07 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms