Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RNF17Q9BXT8 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms