Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VN1R3Q9BXE9 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms