Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTF0

THUMPD2, THUMP domain-containing protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THUMPD2Q9BTF0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
THUMPD2Q9BTF0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
THUMPD2Q9BTF0 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms