Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRF8

CPPED1, Serine/threonine-protein phosphatase CPPED1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPPED1Q9BRF8 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CPPED1Q9BRF8 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms