Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
LPIN3Q9BQK8 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms