Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLF1Q9BQI6 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms