Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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CITED1Q99966 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
CITED1Q99966 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
CITED1Q99966 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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