Protein–RNA interactions for Protein: Q99963

SH3GL3, Endophilin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL3Q99963 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SH3GL3Q99963 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SH3GL3Q99963 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms