Protein–RNA interactions for Protein: Q99717

SMAD5, Mothers against decapentaplegic homolog 5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD5Q99717 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
SMAD5Q99717 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SMAD5Q99717 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms