Protein–RNA interactions for Protein: Q99697

PITX2, Pituitary homeobox 2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX2Q99697 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
PITX2Q99697 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PITX2Q99697 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms