Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
VAT1Q99536 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
VAT1Q99536 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms