Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SNX18Q96RF0 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SNX18Q96RF0 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms