Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
LMTK3Q96Q04 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LMTK3Q96Q04 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms