Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW5

COG8, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG8Q96MW5 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 EIF2B4-201ENST00000347454 1792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COG8Q96MW5 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
COG8Q96MW5 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms