Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SAMD8Q96LT4 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SAMD8Q96LT4 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SAMD8Q96LT4 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
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SAMD8Q96LT4 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SAMD8Q96LT4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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