Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PGBD1Q96JS3 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PGBD1Q96JS3 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms