Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
DCHS1Q96JQ0 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms