Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCDC136Q96JN2 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCDC136Q96JN2 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms