Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM3

CHAMP1, Chromosome alignment-maintaining phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 812 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAMP1Q96JM3 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAMP1Q96JM3 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CHAMP1Q96JM3 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms