Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
HIC2Q96JB3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
HIC2Q96JB3 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms