Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
ZBED3Q96IU2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
ZBED3Q96IU2 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
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