Protein–RNA interactions for Protein: Q96H22

CENPN, Centromere protein N, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPNQ96H22 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
CENPNQ96H22 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms