Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
SCARF2Q96GP6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SCARF2Q96GP6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms