Protein–RNA interactions for Protein: Q96F86

EDC3, Enhancer of mRNA-decapping protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC3Q96F86 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
EDC3Q96F86 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SMN1-211ENST00000625245 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
EDC3Q96F86 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms