Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
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SMIM12Q96EX1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
SMIM12Q96EX1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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