Protein–RNA interactions for Protein: Q96ER9

CCDC51, Coiled-coil domain-containing protein 51, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC51Q96ER9 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CCDC51Q96ER9 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CCDC51Q96ER9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms