Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
CMTM5Q96DZ9 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
CMTM5Q96DZ9 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms