Protein–RNA interactions for Protein: Q96B26

EXOSC8, Exosome complex component RRP43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC8Q96B26 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXOSC8Q96B26 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXOSC8Q96B26 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms