Protein–RNA interactions for Protein: Q96AJ9

VTI1A, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VTI1AQ96AJ9 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
VTI1AQ96AJ9 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms