Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
UTP4Q969X6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms