Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SNX21Q969T3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SNX21Q969T3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms