Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMARCE1Q969G3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMARCE1Q969G3 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms