Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC22.2■■□□□ 1.15
GTF3C6Q969F1 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
GTF3C6Q969F1 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms