Protein–RNA interactions for Protein: Q969E2

SCAMP4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAMP4Q969E2 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
SCAMP4Q969E2 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms