Protein–RNA interactions for Protein: Q92994

BRF1, Transcription factor IIIB 90 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRF1Q92994 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BRF1Q92994 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRF1Q92994 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRF1Q92994 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
BRF1Q92994 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BRF1Q92994 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms