Protein–RNA interactions for Protein: Q92878

RAD50, DNA repair protein RAD50, humanhuman

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD50Q92878 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAD50Q92878 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAD50Q92878 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms