Protein–RNA interactions for Protein: Q92546

RGP1, RAB6A-GEF complex partner protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGP1Q92546 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RGP1Q92546 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RGP1Q92546 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms