Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HERVK_113Q902F9 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
HERVK_113Q902F9 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms