Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUM0

NUP133, Nuclear pore complex protein Nup133, humanhuman

Predictions only

Length 1,156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP133Q8WUM0 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NUP133Q8WUM0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NUP133Q8WUM0 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms