Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHV4

NEDD1, Protein NEDD1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD1Q8NHV4 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEDD1Q8NHV4 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEDD1Q8NHV4 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms