Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
ATG16L2Q8NAA4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
ATG16L2Q8NAA4 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms