Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA66

CNBD1, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD1Q8NA66 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CNBD1Q8NA66 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms