Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA47

CCDC63, Coiled-coil domain-containing protein 63, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC63Q8NA47 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CCDC63Q8NA47 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LRR1-202ENST00000318317 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CCDC63Q8NA47 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms