Protein–RNA interactions for Protein: Q8NA03

FSIP1, Fibrous sheath-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSIP1Q8NA03 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
FSIP1Q8NA03 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
FSIP1Q8NA03 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms