Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9V6

ANKRD53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD53Q8N9V6 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
ANKRD53Q8N9V6 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms