Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Q1

FAM71E2, Protein FAM71E2, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71E2Q8N5Q1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FAM71E2Q8N5Q1 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms