Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3U1

Putative uncharacterized protein LOC400692, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q8N3U1 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Q8N3U1 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Q8N3U1 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC019209.2-201ENST00000545704 373 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Q8N3U1 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms