Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW5

RPAP2, Putative RNA polymerase II subunit B1 CTD phosphatase RPAP2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPAP2Q8IXW5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RPAP2Q8IXW5 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RPAP2Q8IXW5 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms